クリアするとクリアボーナスが得られます。内容は以下の通り。

クリアボーナス（1周目）

1. 片手剣「古の覇王」入手
2. 12000G
3. 「マスクレスオーブ」入手
4. 全ての仲間が全ミッションで使用可能になります
5. 秘められたオーバードライブが全て解放されます
6. ムービーセレクターが使用可能になります
   マップ上に「ムービーセレクター」と言う地名が現れ、そこで鑑賞できます。

クリアボーナス（2周目）

1. 斧「封斧・破天の鼓動」入手
2. 180000G
3. 「ホーリーエリスオーブ」入手
4. 「ナイトノウェオーブ」入手
5. ムービーセレクターにムービー追加。

クリアボーナス（3周目）

1. 300000G
2. 「スーパーノウェオーブ」入手
3. 「ナイスガイオーブ」入手
4. ムービーセレクターにムービー追加。

もう一つ、4周目以降＆武器100％収集でワールドマップ左下の海から「エクストラバトルセレクター」が使用できるようになります。
※エクストラバトルセレクターはボスバトルをプレイできるものです。

2周目に引き継がれる内容

1. 入手した武器・アイテム・装飾品
2. 武器のレベル
3. お金
4. プレイ時間
5. キャラクターのレベル

引き継がないもの

1. 宝箱から入手する地図

お金はクリアボーナスで大量に入手できるので、3周やるのでしたら周回を重ねることで楽にお金を稼ぐことができます。
フリーミッションなどでお金を稼ぎたいなら、お勧めは女神の城のフリーミッションです。
ここでは、敵を無視して木箱などからお金だけを入手して移動すると、5分程度で1万G弱入手することが出来ます。
一例ですが、以下のマップの通りに移動していくとよいでしょう。　（なお、2つの宝箱は1回目のみ武器が入手できます）